此病应与釉质发育不全相鉴别。

1.釉质发育不全中白垩色的周界清晰，其线条与釉质的生长发育线平行；氟斑牙是一种久治不愈的损伤，所以其斑块呈云状分散，周界不清，与生长发育线不一致。

2.釉质发育不全可发生在单个牙齿或一组牙齿上；然而，大多数牙齿都会发生氟中毒，尤其是上颌前牙。

3.氟斑牙患者可能有在高氟区的生活史。

最理想的防治方法是选择含氟量合适的新水源，或分别用活性铝矾土或活性骨炭去除水源中过量的氟，但后者价格昂贵，难以推广。